Было обсуждение в другой теме. Вот выдержки из него
Цитата(Stanislaw @ 28.10.2010, 3:22)

Анализировал кто-то гаплётыпы палео-американское гаплёгрупы R (в этом R1a)?
Говорят, что очень отличаются от европских!

.
Asymmetric Male and Female Genetic Histories among Native Americans from Eastern North America
1.Deborah A. Bolnick*, 2.Daniel I. Bolnick† and 3.David Glenn Smith
http://mbe.oxfordjournals.org/content/23/11/2161.abstractВ этой статье о гаплогруппах Северной Америки (американских индейцев) нет R1a, есть только древние R1 (R1-M173), потому они и не похожи на европейские. Спасибо за статью, она загоняет очередной гвоздь в гроб противников появления древних гаплогрупп линии R в Южной Сибири.
В статье приведены древние гаплотипы (древние в отношении их общего предка) гаплогрупп Q, C и R1. На дереве гаплотипов видно, что все они имеют примерно одинаковый возраст. Дерево имеет, естественно, отдельные ветви для этих гаплогрупп, но все ветви (все в глубоких мутациях) имеют примерно одинаковую высоту, и значит, близкий возраст.
Это означает, что все эти гаплогруппы уходили в Америку в древние времена, и ясно, что из Сибири. Близкий возраст может означать, что они все уходили в одно и то же время, или что все прошли примерно одинаковые бутылочные горлышки популяции. В любом случае, эти гаплогруппы "связаны одними узами" в древние времена, и в первую очередь территориальными. Там же в списке есть и два гаплотипа родительской (для Q и R) гаплогруппы Р-М45*, которые на 10 маркерах различаются на 9 мутаций (!). Это формально дает 16725 лет от их общего предка. Понятно, что для двух гаплотипов расчет неточный, но важен порядок величины. Он примерно соответствует времени древних миграций сибиряков в Америку. Значит, гаплогруппа R1 была там же, среди мигрантов, и уж они, конечно, не из Турции-Ирана туда пришли.
Цитата(Stanislaw @ 28.10.2010, 17:22)

Анализировал кто-то гаплётыпы палео-американское гаплёгрупы R (в этом R1a)?
Говорят, что очень отличаются от европских!

.
Asymmetric Male and Female Genetic Histories among Native Americans from Eastern North America
1.Deborah A. Bolnick*, 2.Daniel I. Bolnick† and 3.David Glenn Smith
http://mbe.oxfordjournals.org/content/23/11/2161.abstractSupplementary material: Contribution binary marker/microsatellite haplotypes
http://mbe.oxfordjournals.org/content/supp...e012_msl088.pdfУважаемый Stanislaw, спасибо за ссылку.
В экспериментальной части статьи говорится, что типирование делали только на 7 снипов: М19 (Q1a3a1a по ISOGG-2010), М3 (Q1a3a1), М242 (Q), М45 (Р), М173 (R1), YAP (DE) и М130 (С). Более глубокого исследования не проводили. Очевидно, в списке гаплотипов, положительных на М173, должны сидеть как R1a, так и R1b, а также, возможно, гаплотипы, не попадающие в эти 2 субклада. Отсюда и столь древний общий предок.
При беглом взгляде на список видно, что там представлены как атлантический модальный гаплотип R1b1b2 (в количестве 6-ти штук), так и базовый гаплотип центральной евразийской ветви R1a1 (1 шт.). Проверил в YSearch на матчи несколько гаплотипов, заметно отклонявшихся от известных модалов - совпаденцы, полные или отстоящие на 1 мутацию, как правило, находились среди носителей R1b. Так что из представленного в статье списка сложно сделать вывод, относятся ли все гаплотипы М173 к метисам - потомкам европейских колонистов (как постулируют авторы статьи), или среди них есть те, что родом прямо из Сибири.
Очевидно, что значительная часть индейских R1 происходит от метисов, принятых в племена. Это была обычная практика, если отец ребенка - белый, а мать, член племени - его "
временная жена". То, что в списке из 281-го гаплотипа 36 были отнесены к "прочим гаплогруппам", говорит о значительной доле "пришлых" Y-хромосомных линий в индейских племенах восточной и центральной части США. Поскольку эти "прочие" разбросаны бессистемно среди географически и этнически удаленных популяций, логично предположить, что статистика гаплогрупп среди индейско-европейских метисов должна в целом совпадать со статистикой для англоязычных жителей США. Испаноязычных и американцев азиатского происхождения можно исключить из анализа, поскольку их вклад в родословную племен крайне невелик - они в основном иммигрировали уже после того, как сложилась система индейских резерваций, с их весьма ограниченными контактами с внешним миром.
Иными словами, среднестатистическим отцом среднестатистического метиса должен быть некоторый среднестатистический американец, живший в стране в начале-середине 19-го века. Очевидно, этого среднестатистического американца могут с большой долей вероятности представлять носители самой распространенной американской фамилии - Смит (Smith). В FTDNA есть проект
Smith-Worldwide, с него и была взята такая статистика. Для статистики по (предположительно) пришлым гаплотипам в имдейских племенах использовались данные из Supplementary Materials для гаплогрупп R1, DE и Others. Отнесение последних было сделано с помощью предиктора
Whit Athey.
Вот результаты в процентах:
...........Amerinds (N=111).......Smiths (N=252)
R1................67,6..........................64,7
I1.................17,1..........................18,3
I2..................6,3............................6,3
E1b1a............2,7............................2,0
E1b1b............1,8............................6,0
J2..................2,7............................1,2
G2.................1,8............................1,6
Судя по практически одной и той же представленности "не-индейских" гаплогрупп в сравниваемых популяциях (за исключением почему-то E1b1b), основным источником появления R1 у североамериканских индейцев можно считать межрасовые браки. В условиях геноцида 19-го века (если называть вещи своими именами) племена не могли позволить себе роскошь изгонять из своей среды детей, прижитых от белого фермера, охотника или торговца. Кроме того (что немаловажно) эти дети могли унаследовать от своих европейских (а на 3 % и африканских E1b1a) отцов иммунитет к болезням, что выкашивали целые племена. Вполне могла возникнуть ситуация, когда из всех мужчин племени выживали лишь "бастарды", с которых род начинался заново. Пример - племя чиппева из резервации Turtle Mountain, в котором 48 человек из 51-го протестированного несли в своих ДНК гаплотипы среднестатистического Смита.
Сказанное выше не означает, что среди представленных 75-ти гаплотипов R1 нет тех, что достались не от европейских отцов, а являются реликтами древней миграции из Азии. Однако, опознать их в таком коротком формате, да еще без более глубокого типирования весьма и весьма сложно.
Цитата(aklyosov @ 31.10.2010, 4:26)

Я только с трудом себе представляю, чтобы в американских индейцах было столько европейских Y-хромосом, и чтобы тестирующие были бы столь безразличны к биографии тестируемых индейцев. А ведь при отборе тестируемых особое внимание уделяется тому, чтобы тестировалось именно "нативное", автохтонное население. Конечно, все может быть, но не таких же пропорциях!
В экспериментальной части говорится, что образцы крови были взяты на условиях полной анонимности у тех членов племен, кто имел, как минимум, 3 из 4-х бабушек-дедушек родом из той же популяции, к которой принадлежат они сами. На образцах не был отмечен даже пол испытуемых, для чего понадобилось проводить отдельный отбор. Так что реальные биографии исследователям были неизвестны.
Далее, из исследованных 16-ти популяций львиная доля "гаплотипа Смита" (105 из 111) приходится всего на 4 из них: это племя чиппева из Северной Дакоты (резервация Turtle Mountains) и Висконсина, и племя чероки из Северной Каролины (резервация Silwell) и Оклахомы (резервация Red Cross). Надо смотреть историю этих конкретных племен. Возможно, по каким-то причинам среди них доля метисов оказалась выше, чем для других.
Цитата(Ostan @ 31.10.2010, 5:44)

Для справки: маркер DYS392 не является слишком медленно мутирующим. Во всех европейских ветках R1b присутствуют, как минимум, пара его мутаций, что относит время его матожидания единичной мутации к диапазону 2000-3000 лет. Наиболее часто встречается значение маркера 14 среди англичан, шотландцев и ирландцев...
Это понятно, в субкладе М222 DYS392=14 вообще базовый. А их у шотландцев, например, четверть от всех гаплотипов R1b1b2. Но на то и ДНК-генеалогия, что смотрится не одна единица информации, а в комлексе. В комплексе у этого субклада базовый DYS385b=13 (DYS385 11-13). У индейцев с DYS392=14 , в DYS385 там 11-11, 9-15, 11-14, что не подпадает под М222, тем более что этот субклад молодой, и базовые аллели держатся. Но у нескольких человек есть и 11-13, что может оказаться М222.
Похоже, там есть и недавние европейские, и древние. Нужны длинные гаплотипы, чтобы понять. В любом случае, авторы подобный анализ не проводили, а просто постулировали, что все молодые. О древних там речи просто не было.